ついさっき、「モブログ うごかねー」を投稿しましたが、原因がわかりました。たぶん。
moblog.uva.ne.jpを利用させていただいているのですが、どうやら、MT3.2にアップグレードしたときに、mt.cfgをそのまま残してあったのがいけなかったようです。
MovableTypeはVer.3.2からmt.cfgが不要となりました。sixapartの更新履歴によると、
環境設定ファイルが、セキュリティ上の理由からmt.cfgからmt-config.cgiに変更になりました。 下方互換性のため mt.cfg が存在していれば読み込まれます。
Movable Type 3.2 マニュアル - 更新履歴
とのことで、mt.cfgを残しておくと読み込まれる設定になっているようで、もしかしてこれが原因!?と思ってサーバから削除してみると、見事にmt-xmlrpc.cgiが動くようになりました。そういえば、インストール手順のどっかにも書いてあったような気もします・・・。
ということで、moblog.uva.ne.jpでも、MTmailでも投稿できるようになりました。
・・・でも、文字化けの問題が再発。
なんでだろー?
◆追記◆
文字化けの件ですが、どうやらMT3.2の環境では「モブログの文字化け」の作業をしなくてもデフォルトで文字化けしなくなっているようです。
lib/MT/XMLPRCServer.pm
をもとに戻したら解決しました。

はじめまして。
MT3.2でのMoblogに挑戦して、snufkinさんと同じところでつまづいていました。
こちらのエントリを読ませていただいて、やっと解決しました。ありがとうございます。
トラックバック打たせていただきますね。
> ふっちゃん さん
はじめまして。
コメント&トラバありがとうございます。
意外な盲点ですよね。お役に立てて幸いです。